CDS
Accession Number | TCMCG015C02240 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_027116052.1 |
Location | join(48958611..48958659,48959287..48959367,48959613..48959772,48959902..48960059,48961144..48961300,48961449..48961635,48963250..48963365,48964125..48964209,48965617..48965832,48965919..48966096,48966768..48966896,48967425..48967658,48968215..48969765,48970412..48972882,48973189..48973584,48974390..48974548,48976421..48976924,48977365..48977506,48978004..48978148,48978922..48979057) |
Gene | LOC113733981 |
GeneID | 113733981 |
Organism | Coffea arabica |
Protein
Length | 2417aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA506972 |
db_source | XM_027260251.1 |
Definition | piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X2 [Coffea arabica] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
COG_category | S |
Description | Piezo non-specific cation channel, R-Ras-binding domain |
KEGG_TC | 1.A.75.1 |
KEGG_Module | - |
KEGG_Reaction | - |
KEGG_rclass | - |
BRITE |
ko00000
[VIEW IN KEGG] ko02000 [VIEW IN KEGG] ko04131 [VIEW IN KEGG] |
KEGG_ko |
ko:K22128
[VIEW IN KEGG] |
EC | - |
KEGG_Pathway | - |
GOs | - |
Sequence
CDS: ATGGAAAGTTTTCTTGGCGATTTTGTGCTGCCTTTGCTGCTTTTGATAGCTGGTCTACTAAATTGGAGTTTGATTTCTTTCATTAATTTGGTGGCTTCTCTTGTAATTCGATTTGTGGCCCGAAAAAGAGGATTTCGCTTCAGATGCAGAAATTCGTTGCTATGGTGCATTTTTTTATTTTCTCTTATTGTGATATTTTCACAAGTGACCTTTCTTGTTATATCGGCAATTATGGGTTCGGAATGGACGGTTGCAGATGCCTGGTGGATGAAGCTCATTGGATTGATGAAACTTCAATCCTGGAGATCTCCACTGGTTGTATATCTCCTGATTATACAACTCTTAGTTGCTGTCATTGCGCTAACTGAGATCCAGTGGAACAGATTTGGCTTTTTCCGATTACAAGATTCTTGTTGGGCCTGTTTTTCTTCAGTGGTTGAGCATATAGGTTCTCGTCTTAGGGTGGCTTCCTGCTTGTTGCTGCCTGGCATTCAGTTGGTTGTTGGAATTAGTAATCCTTCTTGGCTTTCTTTACCATTTTTTGTCTGTAGCTGTGTTGGTCTTGTGGATTGGTCTTTAACAAGCAACTTTTTAGGGCTTTTCAGGTGGTGGAAGCTTCTTTGGCTTTATGCTGGCTTCAGCATTTGCTTGTTGTATGTGTATCAGCTCCCAGTTGGCTTCCCAGAGATTTTCAACATGATAGCCAATTTCGTTGGTCTGTACAAACTTTCTCCAAAATCTGATTTGCAAGAAATTTCTTCCAGTCTTTCTTTGATGGCATTTTACTATGTGCTCTCCTGCGTGAAGTGTGATTTGGAGGAAATGGATTTCCTTATGTCCATAAGAGAGGGAAGCTTGACCGAGCAACTTCTGCCCTCAAGGCATCCATTTTTTATTCGTGAATTGAGATCTGGTGTAAGGCATGCAAATGTATTTTTAAGGAGAACAGTTTTCCGGTATTTCACTATCAACTTTTTCACGTATGGTTTTCCGGTCTCCTTGTTTGCACTTACATTTTGGAGCTTCCACTTCGCGAGTATATGTGCATTTGGATTGCTTGCATATGTTGGGTACATTTTATATGTTTTCCCTTCCTTGTTCCGTCTGCACCGATTAAATGGGTTGCTTCTTGTCTTTATTCTCTTGTGGGCGGTCAGCACATATGTCTTCAATGTGGCATTTGCTTTCATGAATTGGAAACTTGGAAAGGACATGGAAATCTGGGAGATGGTTGGGCTGTGGCATTATCCCATTCCTGGCTTCTTCCTACTTGCTCAATTTTGTCTTGGAATTCTTGTTGCTCTTGGTAACCTAGTTAACAATACTGTTTTTCTCTGCACATCAGATGAGGAGGGGCAGTCATCAAAGGACTACTACAAAGAGGAAGTGAATGAAGAAACCAAAGTCCTTATTGTGGCTACAATAGCTTGGGGATTGCGCAAATGTTCTCGTGCCATCGTACTGGTGCTGATATTCCTTATAGCAATGAAACCTGGTTTCATCCATGCCGTGTATGGTCTCCTTGAAAGTGATAGTTCTTGGGATTTCCTCGAAATAGCTCTGCTCGCATGCTTTTGTGCAATTCATAATCATGGGTTCGAAATGTTGTTTTCATTTTCTGCAATCGTACAGCACACACCCAGTCCTCCAGTTGGATTTAGCATTTTGAGAGCTGGATTGAATAAATCAGTTTTGCTGTCAGTCTATGCCACCTCAAGCACCAGGGACAGTCATGACAATGCCTCCCATGAGAAAAGAATTGCTCTGTATCTTGGCGCGATAGGGAAGAAATTTTTGTCTGTGTATAGATCATTTGGAACCTACATCGCGTTTCTGACCATTCTTCTAACAGTTTACCTGGTGAGGCCTAATTGTTTGGCATTTGGGTACATTTTCCTTCTCCTTGTCTGGATTATCGGAAGACAACTTGTGGAAAGAACAAAACGACGTCTTTGGTTTCCACTAAAAGCGTATGCAATCATAGTCTTCATTTTCGTCTATAGTTTGAGCATTTTCCCCACTTTTGAGGCTTGGATGTCTGCAAAATTCAATCTTCAGTTGTATTTTGGCTATAACCCCGGTTCTTCATTACTGGAAAATGTTTGGGAGTCTTTAGCAATTGTAGTCGTAATGCAACTTTATAGCTATGAGAGGAGACAGAGCAAAAGTGTTAGATCAGAGGAATCAGATTTTTCTCAATTTGGGATTTTGGGGTTCATCAGACGCTGCCTAATCTGGCACAGTCATAAGATCCTGTTGATTGCATTGTTTTATGCTTCATTATCTCCAATAAGCGCATTTGGTGTTTTGTACCTTCTTGGTGTTGTCTTTTGTTCAACTTTATCTAAAGCTTCCCGAATTCCATCCAAATCATTCTTGATCTATACGGGTGTTCTAGTGACATCTGAGTATCTGTTTCAGATGTGGGGTGAATATGCTGAAATGTTTCCTGGACAAAGGCACTATGATCTATCCCTCCTCCTGGGGTTTCAGGTATACAAACCAAATTTCTGGGGTATAGAAGCTGGCTTGAGGGCAAAAGTTCTTGTGATTGCTGCATGTACCCTTCAGTATAATGTCTTCCATTGGTTGGAGAGGATGCCCACTTTTCTTGTAGATGTAGTTAATTCGGAGGAGCCTTGCCCACTTTTTGTCTCTGCAGAAGACGTCCTACCTGTTGTTTCAGTGCCCAATGGTGAAAATGACGCATCATCAAGTTTCAATGAACGATCTTCAAGAAAGATAGGAGTCACGAGTAGTTCATTGCCTACATTCAGCCCTGGTCTTTACCAATCATCTCATGATGTGTCCACGGCTGGAGTAGGATATAAGGATCACAATACTAGAAAATACTCATTTGGGCATATATGGGGGAGTGTGAAGGAGAGTCATAAGTGGAACAAGAAGAGGATTCTTGCCTTGAGAAGGGAGAGGTTTGAAATCCAAAAGACTACCTTGAAGATATATTTGAAGTTTTGGATAGAGAACATGTTTAACCTTTTTGGCCTTGAGATCAACATGATTGCTCTACTATTGGCCAGTTTTGCTCTTCTGAATGCAATTTCTTTGCTCTATATTGTATCACTTGCAGCTTGTGCTCTTTTAGAGCGGCATATACTTCGGAAACTATGGCCAATGTTCGTCTTCTTGTTTTCTCTTATCCTTGTGTTTGAATACTTTGCCATGTGGAAGCACCTCATGCCGTTGGATCCACATGTTTCAAGTGACACTAATGTGCATTGCCATGATTGCTGGAAAATCTCAAACTTATATTTTGCTCATTGCAGGAGCTGTTGGTTGGGGCTTATTGTTGATGATCCCCGAATGCTGATTAGCTACTTTGTCGTCTTCCTGCTTGCATGTTTTAAGCTCCGTGCAGATCATGCTTCAAGTTTCTCTGGATCATTTACATATCGCCAGATGGTTTCTCAAAGGAAAAACGCTTTTGTTTGGAGAGATCTGTCATTTGAAACCAAAAGCATGTGGACTTTCCTTGACTATTTGCGGCTTTATTGCTATTGTCATCTGTTAGATCTTGTGCTTGCTTTGGTTCTGATTACAGGAACCCTTGAATATGATATTCTGCACCTAGGATATCTTGCTTTTGCTTTGATTTTCTTTCGGATGAGGCTTACGATATTAAAAAAGAAAAACAGTATCTTTAAGTATCTGCGCATATACAATTTTGGAGTTATTGTTCTTTCTCTTGCATATCAATCTCCTTTTGTGGGTGATTTTAGTGGGGGAAAGTGTGAAACTATTGATTACATATATGAGGTGATTGGATTCTACAAATATGACTATGGGTTCCGGATAACCTCCAGATCTGCTTTAGTTGAGATAGTCATTTTTGTTCTGGTATCACTACAGTCATACATGTTTTCCTCCCCTGAGTTTGATTACGTATTTCGGTATCTTGAAGCGGAGCAAATTGGGGCTATTGTACATGAGCAAGAGAAGAAAGCTGCATGGAAAACTGAACAGTTTCTTCACATTCGTGAATCTGAAGAGAAAAAGCGCCAGCGCAACTTCCAAGTAGAGAAGATGAAGTCCGAGATGCTTAATTTACAAATCCAGCTTCATAATATGAACTCTACATCTGCATGTGATGACTCTTCTCCTGCAAGTGAAGGGCTTAGAAAGAGGAAGAATGCCACAGTAAATACAAATATGAACAGTGGAATTCTTGAAAAGCAGGATATTAATACTCATCCTGATTCAGGTTTTGCATTTGATCTGTACGGTTCTCCAAGTAATGTAAGAGGAGAGAGTCCTTTTACAATGGAATTTGCAAAGCAACCAATAGAATCTCCTCTTGGAGAGATCACTGAGCTTGAGGAATGTACAAGTGAAGGTTCATTTCTGGAGTCTGACAGAGAAAGGAAAGGCAGAGGCCAAGCAAGTGAAAACCCTTTAGTCTCTGCTGTACAGTTGATTGGTGATGGTGTTTCTCAAGTGCAATCAATAGGAAACCAAGCAGTTAACAATATTGTGAGCTTTCTTAATATTGCACCTGAAGATTCAGATACAAATGAGCACACAGCTGCTGAGGAGGGGGTCTTTCAGGAGAGTGAGAGCCAAAATGTGAGGTACGCATGCTTGGATCGTGCCTCTTCTGTGCAATCTGACAGAAGTAGAGCATCTGACACTGCAAGTTTGCAGATTGGAAGGATCTTTGGCCATATTTGGTCTCAGATGCGGTCGAATAATGATGTTGTTTGTTACATTTGCTTTGTACTGGTATTTCTGTGGAACTTTAGTTTGCTTTCGATGGTTTATTTGGCAGCTCTATTCTTGTATGCTCTTTGTGTCAACACAGGGCCAAGTTACACTTTTTGGGTTATCATGCTAATCTACACTGAAATTTATATATTGATTCAGTACCTGTATCAAATTGTGATCCAACATTGTGGTTTCAGCATCCAGTCAAGCCTTCTTCAAGAACTTGGGTTTCCAACAAAGAGGATAAAGTCATCATTTGTGATAAGTACATTGCCTCTTTTTCTAGTGTATCTATTTACTCTTGTTCAGAGCTCTATAACTGCCAAAGACGGTGAATGGTTTTCGCCAGGGTTTAGTAAGGGGAGATTGTTGCACCGCAAGGAGGTTCTGCAGGTTTCTACTTTGAGTGGGACAGCAAAGGAGCTGGTCCAGCTAGTGGCAAAAATGGTCAAAATGGTGATTAGCAGCTGCAGTACATATTGGAAATCACTGACACAGGAAGCAGAATCTCCTCCATACTTTGTCCAGTTGTCTATGGATGTTCATTTGTGGCCAGAAGGTGGAATTCAACCAGAGAGGATAGAATCTGGAATTAATCGTCTGCTACAGCTTGTTCATGATGAGAGATGCAAAAATGAAAATCATTGTTCTTGTGCTAGTAGGGTTCAAATTCAAAGTATTGAAAAGAGTACAGAAAACCCAAATGTTGCCTTAGCTGTTTTTGAGGTGGTTTATGCCTCACATAGTGAGGAATGTAATGCCAAAGAACAGTACGAGTCCCTAACACCAGCGGCTGATGTAGCAAAAGAGATCCTTGAAGCACATAATGCTGGTTTTACAGAGGGAATTGGATTTCCTTACCATATAATCTCTGCTATTGGAGGTGGTAAAAGAGAAGTTGATCTCTATGCCTACATATTTGGTGCAGACTTGTCTGTTTTCTTTTTGGTTGCTATTTTCTATCAATCTGTCATAAAAAACAAAACTGAGTTTCTCGAGGTTTATCAGCTTGAGGACCAATTTCCCAAAGAGTTCGTATTTATTCTAATGGCTATCTTCTTCTTGATCGTAGTTGATCGTGTTATCTACCTCTGTTCTTTTGCCACAGGAAAAGTTATATTCTATCTGTTCAATCTTATCCTTTTTACCTGTGCGGTCACACAGTATGCCTGGCACATGGATACCTCCCAGCAAAACACTGCAGGTTTAGCTCTTCGTGCAATATATCTGACTAAAGCAATTTCTCTGTCACTACAAGCTATGCAAATCCAATATGGGGTACCACATAAGAGCACCCTGTACCGGCAGTTCCTCACCAGCAAAGTTTCCCGAGTGAATTATCTAGGTTATCGGCTTTACCGTGCCCTGCCTTTTCTATATGAACTACGATGTGTTCTTGATTGGTCGTGCACTACAACAGCATTGACAATGTATGATTGGCTGAAGTTGGAGGACATTAATGCAAGCTTGTACCTCGTCAAATGTGATGCTGTTCTTAATAGGGCTAGACACAAGCAAGGGGAGAAGCAGACCAAATGGACCAAGTTTTGCAATGGGATATGCTTATTCTTCATTTTAATTTGTGTAATTTGGGCTCCTATGCTGATGTATAGCAGTGGTAATCCAACAAATATTGCGAATCCCATAAATGATGCAACTGTTCAGCTTGATATCAAGACAGGTGGTGGAAGGTTGACGTTGTACCAGACCACTCTTTGTGAAAAAATTTCGTGGGATCAGCTGAACACAGTCATTGATCTTGATCCTCAAGGTTATTTGGATACATACAATGTGCGTGACATCCAACTGGTTTGCTGTCAATCTGATGCGAGTACTTTGTGGCTTGTCCCTCATATGGTGCAGAGAAGGTTCCTTTGGTCTCTCAATGAAGAGATGAATATCAAGTTTTCTTGGATTCTTACCAGAGACAGACCAAAGGGCAAGGAAGTTGTTAAATATGAAAGAACAGTTGATCCAATGGATTGCCCAAAACCATCAGAGGTTGAGGCAGTGTTTAATGGCACTAGTAGTAGTTTTCGGGTGCGAAACATCTATCCAAGATATTTTCGCGTTACTGGTTCGGGTGATGTTAGGCCTTTTGAACAGGAGGCTAACGATGTCAGTGCTGACCTTGTCCTTAATAATGGGAATTTGGAATGGTGGTCCTTTCATGATATCAATTCGTTGGATGTTAGTGGCTGTGGAGGGTTAAAAGGGCCAATGGCCATCATTGTATCAGAAGAAACCCCACAGGGTTTCCTTGGCGAGACGCTCAGCAAATTCAGTATCTGGGGCCTGTACATTACATTTGTGCTAGCAGTTGGACGCTTTATCAGACTTCAGTGCTCTGATTTGCGAATGAGGATCCCATACGAGAATCTTCCTTCTTGCGACAGGTTGATCGCCATCTGTGAGGATATATATGCTGCTAGAGCAGAGGGAGAACTTGGAGTAGAAGAGATCCTATATTGGACGCTGGTGAAGATTTACAGGTCACCTCATATGTTGCTTGAGTACACGAAGCCAGACTAG |
Protein: MESFLGDFVLPLLLLIAGLLNWSLISFINLVASLVIRFVARKRGFRFRCRNSLLWCIFLFSLIVIFSQVTFLVISAIMGSEWTVADAWWMKLIGLMKLQSWRSPLVVYLLIIQLLVAVIALTEIQWNRFGFFRLQDSCWACFSSVVEHIGSRLRVASCLLLPGIQLVVGISNPSWLSLPFFVCSCVGLVDWSLTSNFLGLFRWWKLLWLYAGFSICLLYVYQLPVGFPEIFNMIANFVGLYKLSPKSDLQEISSSLSLMAFYYVLSCVKCDLEEMDFLMSIREGSLTEQLLPSRHPFFIRELRSGVRHANVFLRRTVFRYFTINFFTYGFPVSLFALTFWSFHFASICAFGLLAYVGYILYVFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYVFNVAFAFMNWKLGKDMEIWEMVGLWHYPIPGFFLLAQFCLGILVALGNLVNNTVFLCTSDEEGQSSKDYYKEEVNEETKVLIVATIAWGLRKCSRAIVLVLIFLIAMKPGFIHAVYGLLESDSSWDFLEIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAIVQHTPSPPVGFSILRAGLNKSVLLSVYATSSTRDSHDNASHEKRIALYLGAIGKKFLSVYRSFGTYIAFLTILLTVYLVRPNCLAFGYIFLLLVWIIGRQLVERTKRRLWFPLKAYAIIVFIFVYSLSIFPTFEAWMSAKFNLQLYFGYNPGSSLLENVWESLAIVVVMQLYSYERRQSKSVRSEESDFSQFGILGFIRRCLIWHSHKILLIALFYASLSPISAFGVLYLLGVVFCSTLSKASRIPSKSFLIYTGVLVTSEYLFQMWGEYAEMFPGQRHYDLSLLLGFQVYKPNFWGIEAGLRAKVLVIAACTLQYNVFHWLERMPTFLVDVVNSEEPCPLFVSAEDVLPVVSVPNGENDASSSFNERSSRKIGVTSSSLPTFSPGLYQSSHDVSTAGVGYKDHNTRKYSFGHIWGSVKESHKWNKKRILALRRERFEIQKTTLKIYLKFWIENMFNLFGLEINMIALLLASFALLNAISLLYIVSLAACALLERHILRKLWPMFVFLFSLILVFEYFAMWKHLMPLDPHVSSDTNVHCHDCWKISNLYFAHCRSCWLGLIVDDPRMLISYFVVFLLACFKLRADHASSFSGSFTYRQMVSQRKNAFVWRDLSFETKSMWTFLDYLRLYCYCHLLDLVLALVLITGTLEYDILHLGYLAFALIFFRMRLTILKKKNSIFKYLRIYNFGVIVLSLAYQSPFVGDFSGGKCETIDYIYEVIGFYKYDYGFRITSRSALVEIVIFVLVSLQSYMFSSPEFDYVFRYLEAEQIGAIVHEQEKKAAWKTEQFLHIRESEEKKRQRNFQVEKMKSEMLNLQIQLHNMNSTSACDDSSPASEGLRKRKNATVNTNMNSGILEKQDINTHPDSGFAFDLYGSPSNVRGESPFTMEFAKQPIESPLGEITELEECTSEGSFLESDRERKGRGQASENPLVSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNNIVSFLNIAPEDSDTNEHTAAEEGVFQESESQNVRYACLDRASSVQSDRSRASDTASLQIGRIFGHIWSQMRSNNDVVCYICFVLVFLWNFSLLSMVYLAALFLYALCVNTGPSYTFWVIMLIYTEIYILIQYLYQIVIQHCGFSIQSSLLQELGFPTKRIKSSFVISTLPLFLVYLFTLVQSSITAKDGEWFSPGFSKGRLLHRKEVLQVSTLSGTAKELVQLVAKMVKMVISSCSTYWKSLTQEAESPPYFVQLSMDVHLWPEGGIQPERIESGINRLLQLVHDERCKNENHCSCASRVQIQSIEKSTENPNVALAVFEVVYASHSEECNAKEQYESLTPAADVAKEILEAHNAGFTEGIGFPYHIISAIGGGKREVDLYAYIFGADLSVFFLVAIFYQSVIKNKTEFLEVYQLEDQFPKEFVFILMAIFFLIVVDRVIYLCSFATGKVIFYLFNLILFTCAVTQYAWHMDTSQQNTAGLALRAIYLTKAISLSLQAMQIQYGVPHKSTLYRQFLTSKVSRVNYLGYRLYRALPFLYELRCVLDWSCTTTALTMYDWLKLEDINASLYLVKCDAVLNRARHKQGEKQTKWTKFCNGICLFFILICVIWAPMLMYSSGNPTNIANPINDATVQLDIKTGGGRLTLYQTTLCEKISWDQLNTVIDLDPQGYLDTYNVRDIQLVCCQSDASTLWLVPHMVQRRFLWSLNEEMNIKFSWILTRDRPKGKEVVKYERTVDPMDCPKPSEVEAVFNGTSSSFRVRNIYPRYFRVTGSGDVRPFEQEANDVSADLVLNNGNLEWWSFHDINSLDVSGCGGLKGPMAIIVSEETPQGFLGETLSKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEILYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD |